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Graphviz安装失败的一个尝试

Graphviz来对sphinx进行画图,不过发现一直无法编译出来。

PS:Graphviz的官网在大陆访问非常的慢。

首先参考http://graphviz.org/Download_linux_rhel.php,增加一个repo源,

然后执行yum install 'graphviz*'安装graphviz的软件。

在安装的过程中出现了

Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Hashtbl) = 718cd6ce8bc18371ce22483e362f78b4
Installing: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Hashtbl) = 024edc3512403b725052aec8e41ed971
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Array) = 4d5efba91ec70acd7b184fd4b277708c
Available: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Array) = 8a6bb22925744456eb66180ea42e3344
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(List) = bd7c662c09e850306a62c12fed5ef5ce
Available: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(List) = d757117653d9319fefb7ddc78a998f41
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(runtime) = 4.00.1
Installing: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(runtime) = 4.01.1
ocaml(runtime) = 4.01.0
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Gc) = 23b8d067f883f7a218c4945a42625a31
Available: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Gc) = 292a1cd61d8e068943589882415bdf7d
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Obj) = ad977b422bbde52cd6cd3b9d04d71db1
Available: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Obj) = b0adfa4175f86e4394859886c1a374bb
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Int32) = 265928798c0b8a63fa48cf9ac202f0ce
Available: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Int32) = ad06f04cfca6d404d1de76c3dc67324a
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Callback) = 6fd6d47b2f6a171a493621bc5edbfb32
Installing: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Callback) = 198fb4bcde892143b0866b03cfae8085
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(List) = bd7c662c09e850306a62c12fed5ef5ce
Installing: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(List) = d757117653d9319fefb7ddc78a998f41
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Callback) = 6fd6d47b2f6a171a493621bc5edbfb32
Available: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Callback) = 198fb4bcde892143b0866b03cfae8085
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Pervasives) = 4836c254f0eacad92fbf67abc525fdda
Installing: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Pervasives) = 36b5bc8227dc9914c6d9fd9bdcfadb45
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Hashtbl) = 718cd6ce8bc18371ce22483e362f78b4
Available: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Hashtbl) = 024edc3512403b725052aec8e41ed971
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Pervasives) = 4836c254f0eacad92fbf67abc525fdda
Available: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Pervasives) = 36b5bc8227dc9914c6d9fd9bdcfadb45
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Array) = 4d5efba91ec70acd7b184fd4b277708c
Installing: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Array) = 8a6bb22925744456eb66180ea42e3344
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(runtime) = 4.00.1
Available: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(runtime) = 4.01.1
ocaml(runtime) = 4.01.0
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Int32) = 265928798c0b8a63fa48cf9ac202f0ce
Installing: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Int32) = ad06f04cfca6d404d1de76c3dc67324a
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Gc) = 23b8d067f883f7a218c4945a42625a31
Installing: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Gc) = 292a1cd61d8e068943589882415bdf7d
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Int64) = 0d5ecd8dffcffac43aec2ebe427d3bde
Available: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Int64) = 3945db6e8df0d5a79bcbc949ee550d52
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Obj) = ad977b422bbde52cd6cd3b9d04d71db1
Installing: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Obj) = b0adfa4175f86e4394859886c1a374bb
Error: Package: graphviz-lang-ocaml-2.38.0-1.el7.x86_64 (graphviz-stable)
Requires: ocaml(Int64) = 0d5ecd8dffcffac43aec2ebe427d3bde
Installing: ocaml-runtime-4.01.0-22.6.el7.x86_64 (base)
ocaml(Int64) = 3945db6e8df0d5a79bcbc949ee550d52
You could try using --skip-broken to work around the problem
You could try running: rpm -Va --nofiles --nodigest

看这个论坛说,修改之后,再次安装,果然可以装上。

Just edit the snapshot section so that “enabled=1”, and correspondingly disable the stable section.

[graphviz-snapshot]
name=Graphviz - RHEL $releasever - $basearch
baseurl=http://www.graphviz.org/pub/graphviz/development/redhat/el$releasever/$basearch/os/
enabled=1
gpgcheck=0
skip_if_unavailable=1

[graphviz-snapshot-source]
name=Graphviz - RHEL $releasever - Source
baseurl=http://www.graphviz.org/pub/graphviz/development/SRPMS/
enabled=1
gpgcheck=0
skip_if_unavailable=1

最后安装的dot程序

dot - graphviz version 2.39.20160710.1729 (20160710.1729)
libdir = "/usr/lib64/graphviz"
Activated plugin library: libgvplugin_dot_layout.so.6
Using layout: dot:dot_layout
Activated plugin library: libgvplugin_core.so.6
Using render: dot:core
Using device: dot:dot:core
The plugin configuration file:
        /usr/lib64/graphviz/config6
                was successfully loaded.
    render      :  cairo dot dot_json fig gd json json0 map mp pic pov ps svg tk vml vrml xdot xdot_json
    layout      :  circo dot fdp neato nop nop1 nop2 osage patchwork sfdp twopi
    textlayout  :  textlayout
    device      :  bmp canon cmap cmapx cmapx_np dot dot_json eps fig gd gd2 gif gtk gv ico imap imap_np ismap jpe jpeg jpg json json0 mp pdf pic plain plain-ext png pov ps ps2 svg svgz tif tiff tk vml vmlz vrml wbmp x11 xdot xdot1.2 xdot1.4 xdot_json xlib
    loadimage   :  (lib) bmp eps gd gd2 gif ico jpe jpeg jpg pdf png ps svg xbm

PS:如果有些程序没有安装好,那么没办法生成pdf的格式。

如下面的错误信息,硬是没有pdf的格式。原来是插件没有安装全。

Graphviz produced errors. Verify it has support for filetype=pdf, or use filetype=dot.
Original error: Format: "pdf" not recognized. Use one of: canon cmap cmapx cmapx_np dot eps fig gd gd2 gif gv imap imap_np ismap jpe jpeg jpg plain plain-ext png ps ps2 svg svgz tk vml vmlz vrml wbmp xdot

不过还残留一个没有解决的问题

[stderr]
Warning: flat edge between adjacent nodes one of which has a record shape - replace records with HTML-like labels
  Edge A -> B
Error: lost A B edge

我把两个node放在同一个level,然后做了箭头,报错了,得再研究研究。

分类: Python, 软件

sphinx文档使用graphviz来画图

Sphinx是用来写文档的利器,虽然比Markdown来的麻烦一些,但是功能强大,用起来也还很不错。考虑到不同文档之间内的跳转,还有把文档从拆分成多个小文档,而且reStructuredText语言入门成本不高,所以用了sphinx-docs来做文档的编写。

Word来编写文档?呃。。。请赐我一刀。使用Word来进行编排文档,在多人协作的情况下,简直惨不忍睹,文档的格式乱七八糟。

reStructuredText再通过LeTax来编译生成pdf也是很方便的。

为什么要用graphviz来画图?

画图的软件并不是太多,一般的人会选择使用visio来进行画图,visio来画图确实可以,也无可厚非,所见即所得,容易上手。但是用于一个版本控制的文档,visio的版本控制就不是太好了。用文本来说就方便很多了。

有个ditaa使用ascii字符来画图的,http://ditaa.sourceforge.net/。很多工业界的IETF文档用它来画图

+--------+   +-------+    +-------+
|  cRED  | --+ ditaa +--> |       |
|  Text  |   +-------+    |diagram|
|Document|   |!magic!|    |  cGRE |
|     {d}|   | cYEL  |    |       |
+---+----+   +-------+    +-------+
    :                         ^
    |       Lots of work      |
    +-------------------------+

ditaa

但是和中文结合在一起排版就不是太好了。中文一个字符占两个英文字符的位置,导致原图不和谐。还有另外一个原因,感觉编译ditaa的速度有些慢。

下载安装Graphviz

Windows下载Graphviz,解压到一个路径下,然后把其bin目录加入到环境变量中。在cmd中dot -V来验证是否可以使用dot编译了。

Linux请使用系统自带的包管理程序来安装atp-get install graphviz,和Windows同样的验证方法。

Sphinx 配置文件修改

Sphinx项目也需要做一些变更,因为开启了Graphviz插件。修改conf.py

# 通过配置开启graphviz插件
extensions = ['sphinx.ext.graphviz']

# 设置 graphviz_dot 路径
graphviz_dot = 'dot'
# 设置 graphviz_dot_args 的参数,这里默认了默认字体
graphviz_dot_args = ['-Gfontname=Georgia', 
                     '-Nfontname=Georgia',
                     '-Efontname=Georgia']
# 输出格式,默认png,这里我用svg矢量图
graphviz_output_format = 'svg'

这里graphviz_dot的值是dot,为了不把绝对路径写到配置中,防止其他人的路径不一样,所以这里要求dot这个程序在环境变量中,能够直接使用。

graphviz_dot_args这个参数注意正确使用'-Gfontname=Microsoft YaHei',以下是错误的'-Gfontname="Microsoft YaHei"'。 通过-G, -N, -E 来设置全局的 graphnodeedge 属性。

开始使用Graphviz

好了,接下来就可以在sphinx文档中插入你的图片了。

例如:

.. graphviz::

    digraph abc{
        a;
        b;
        c;
        d;

        a -> b;
        b -> d;
        c -> d;
    }

demo图

简单的图形

或者通过

.. graphviz:: external.dot

这个使用一个dot文件内容。

测试一下你的graphviz能否支持好中文


.. graphviz::
   
   digraph idp_modules{
     fontname = "Microsoft YaHei";
     rankdir = TB;
     fontsize = 12;
     
     node [fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 12, shape = "record" ];
     edge [fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 12 ];
     
         subgraph cluster_sl{
             label="IDP支持层";
             bgcolor="mintcream";
             node [shape="Mrecord", color="skyblue", style="filled"];
             network_mgr [label="网络管理器"];
             log_mgr [label="日志管理器"];
             module_mgr [label="模块管理器"];
             conf_mgr [label="配置管理器"];
             db_mgr [label="数据库管理器"];
         };
     
         subgraph cluster_md{
             label="可插拔模块集";
             bgcolor="lightcyan";
             node [color="chartreuse2", style="filled"];
             mod_dev [label="开发支持模块"];
             mod_dm [label="数据建模模块"];
             mod_dp [label="部署发布模块"];
         };
     
     mod_dp -> mod_dev [label="依赖..."];
     mod_dp -> mod_dm [label="依赖..."];
     mod_dp -> module_mgr [label="安装...", color="yellowgreen", arrowhead="none"];
     mod_dev -> mod_dm [label="依赖..."];
     mod_dev -> module_mgr [label="安装...", color="yellowgreen", arrowhead="none"];
     mod_dm -> module_mgr [label="安装...", color="yellowgreen", arrowhead="none"];
   }

如果你的graphviz能够对上面的片段能够输出全部的中文,那么你的graphviz就对中文支持很好了。如图:

中文识别不太好

如果使用Windows的可能node节点里面的文字会看不见,而Linux下的graphviz可以工作的很好。

在中文label的前面增加一个空白字符,要使用以下的:

.. graphviz::
   
   digraph idp_modules{
     fontname = "Microsoft YaHei";
     rankdir = TB;
     fontsize = 12;
     
     node [fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 12, shape = "record" ];
     edge [fontname = "Microsoft YaHei", fontsize = 12 ];
     
         subgraph cluster_sl{
             label=" IDP支持层";
             bgcolor="mintcream";
             node [shape="Mrecord", color="skyblue", style="filled"];
             network_mgr [label=" 网络管理器"];
             log_mgr [label=" 日志管理器"];
             module_mgr [label=" 模块管理器"];
             conf_mgr [label=" 配置管理器"];
             db_mgr [label=" 数据库管理器"];
         };
     
         subgraph cluster_md{
             label=" 可插拔模块集";
             bgcolor="lightcyan";
             node [color="chartreuse2", style="filled"];
             mod_dev [label=" 开发支持模块"];
             mod_dm [label=" 数据建模模块"];
             mod_dp [label=" 部署发布模块"];
         };
     
     mod_dp -> mod_dev [label="依赖..."];
     mod_dp -> mod_dm [label="依赖..."];
     mod_dp -> module_mgr [label="安装...", color="yellowgreen", arrowhead="none"];
     mod_dev -> mod_dm [label="依赖..."];
     mod_dev -> module_mgr [label="安装...", color="yellowgreen", arrowhead="none"];
     mod_dm -> module_mgr [label="安装...", color="yellowgreen", arrowhead="none"];
   }

修正后,可以更好的支持中文了。

修正后,中文识别的更好

参考

分类: 实用技巧

Sublime Text预览Graphviz图

经常用Sublime Text来进行画Graphviz图,如果每次用命令行来进行预览就麻烦了。这个时候当然要利用热心的网友提供的插件了。

下载安装Graphviz

Windows下载Graphviz,解压到一个路径下,然后把其bin目录加入到环境变量中。在cmd中dot -V来验证是否可以使用dot编译了。

Linux请使用系统自带的包管理程序来安装atp-get install graphviz,和Windows同样的验证方法。

自动安装插件不兼容Windows

打开Package Control来搜索了一下graphviz,还真的发现了一个插件GraphvizPreview。于是安装它,发现并不能用。使用快捷键win + shift + g 出现

Graphviz: Could not open PDF, only works for Mac… fork this repo for your OS!’

什么情况,插件只能支持Mac,不支持Windows。

上官方的github的issue搜索看了下,有人已经提交了Windows版本的修复,可是Package Control的版本还是很老的,没有把master的版本进行更新。所以通过release版本下载的是2014年4月份的v0.1.1版本,而Windows的修复版本是在2015年2月份。

所以只能通过下载master来进行手动安装。

手动安装步骤

第一步:下载https://github.com/munro/SublimeGraphvizPreview/archive/master.zip 第二步:打开Preferences -> Packages Settings -> Packages Control -> Settings User,来确认一下installed_packages没有GraphVizPreview。并且增加"remove_orphaned": false防止Sublime Text 把手动安装的插件包给删除了。

{
    "bootstrapped": true,
    "in_process_packages":
    [
    ],
    "installed_packages":
    [
        "EncodingHelper",
        "Package Control",
        "Theme - Spacegray"
    ],
    "remove_orphaned": false
}

第三步:打开Preferences -> Browse Packages...进入到Sublime Text的插件包下Packagas

第四步:解压zip文件到Packagas下,并且更改文件夹SublimeGraphvizPreview-masterGraphVizPreview

第五步:重启Sublime Text。

效果图预览

参考

分类: 实用技巧

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